Compte tenu du caractère karstique de la plus grande partie du sous-sol de la région, la mise en conformité des ouvrages rejetant en nappe constitue une priorité.
Le long de la Seine, le niveau d'équipement des systèmes d'assainissement des collectivités est déjà en forte progression.
Dernièrement, à Elbeuf, une installation de 115 000 eh (équivalents habitants) a été ainsi mise en service. Mais du chemin reste à parcourir car neuf stations d'épuration de plus de 10 000 habitants, dont cinq sur le littoral, n'ont toujours pas un fonctionnement satisfaisant.
La mise en conformité de ces ouvrages, qui doit être effective d'ici 2006, doit donc être poursuivie et le bon fonctionnement des installations doit être régulièrement surveillé, de façon à protéger au mieux le milieu aquatique.
Enfin, l'importance de l'assainissement autonome pour les petites collectivités ne doit pas être minimisée car, en secteur Seine-Aval, près de 300 000 personnes sont aujourd'hui concernées. Une des dernières stations de ce type à avoir été construites est d'ailleurs celle, en Pays de Caux, du canton de Bolbec. D'autres doivent suivre.