Cette mission recouvre les activités de gestion et animation des instances de bassin (comité de bassin, conseil d’administration, commissions territoriales…), de communication externe vers les membres des instances de bassin, les maîtres d’ouvrage ou encore vers le grand public, de pédagogie (classes d’eau vers des publics scolaires et professionnels, éducation à l’environnement…) et d’action internationale. 41 agents y contribuent.

En directions territoriales, 66 chargés d’opérations (COP) et assistants d’opérations ont pour mission d’instruire les dossiers de demande d’aides déposés par les maîtres d’ouvrage (collectivités, industriels, agriculteurs, associations).

Au-delà de l’instruction technique et financière des demandes qu’ils reçoivent, ils ont également pour mission d’aller vers les maîtres d’ouvrages pour faire émerger les projets favorisant le bon état du milieu. Les travaux aidés concernent essentiellement l’assainissement et la protection de la ressource en eau.

En directions territoriales, 55 chargés (CAF) et assistants d’aides au fonctionnement accompagnent les industriels et les collectivités, maîtres d’ouvrage, à la mise en place de démarches de progrès visant à réduire leurs impacts sur le milieu naturel.

Ils évaluent la qualité du fonctionnement des ouvrages d’épuration et calculent le montant des aides à la qualité d’exploitation des ouvrages (AQUEX) et des primes pour épuration. Ils calculent les redevances liées à la pollution et au prélèvement. Ces redevances constituent le mode de financement du programme d’intervention de l’Agence et du fonctionnement de l’établissement.

Environ 40 chargés d’études et assistants chargés d’études veillent à la connaissance de la ressource et des différents milieux (eaux souterraines, eaux superficielles continentales ou eaux littorales et marines) en assurant le pilotage des réseaux de surveillance et la réalisation des études.

Environ 30 chargés d’opérations instruisent les aides aux travaux visant à la restauration des milieux aquatiques et humides et pour l’agriculture.
Environ 10 chargés de projet pilotent la déclinaison territoriale du programme de l’Agence (Plan territorial d’actions prioritaires/PTAP, programme de mesures/PDM…) en concertation avec les différents services des directions et acteurs de l’eau.